根据中国法律的规定,一个公司只有一个营业执照,如果你所说的是三个分支机构的营业执照,那么这三个分支机构应该是属于同一个公司的不同经营场所,因此可以向劳动仲裁机构提起劳动仲裁。但是具体情况还需要根据实际情况进行分析,建议您咨询专业律师的意见。