生物信息EVM预测里的编号有什么练习？
2023-07-13 阅读 31
在生物信息中，EVM（Evidence Modeler）是一种用于基因预测的计算工具，它将多种证据来源（如基因组序列、转录组数据、蛋白质序列等）进行整合，生成最终的基因结构预测结果。在EVM预测中，通常会使用一些编号来表示不同类型的证据或特征，这些编号可以用于描述基因的不同区域或功能。以下是一些常见的EVM预测中使用的编号示例：
1. "AUGUSTUS"：表示基于基因组序列和训练模型预测的基因结构。
2. "GeneMark"：表示基于基因组序列和统计模型预测的基因结构。
3. "SNAP"：表示基于比对到相关物种的已知基因的序列预测的基因结构。
4. "EST"：表示基于转录组测序数据的序列预测的基因结构。
5. "Protein"：表示基于蛋白质序列的比对结果预测的基因结构。
6. "Ab initio"：表示基于统计模型或规则的预测，而不依赖于其他证据来源。
7. "Evidence-based"：表示基于多种证据来源整合的综合预测结果。
这些编号可以帮助研究人员了解基因预测结果的来源和质量，进而进行后续的生物信息学分析和实验验证。需要注意的是，具体使用的编号可能会因不同的研究项目或软件工具而有所不同。
更新于 2023年07月13日
