请问除了TCGA外，还有同时包含病理和基因的数据库吗？
2023-11-07 阅读 22
除了TCGA（The Cancer Genome Atlas），还有一些其他的数据库也同时包含病理和基因数据。以下是一些常用的数据库：
1. GEO（Gene Expression Omnibus）：GEO是一个公共基因表达数据库，它包含了来自各种疾病和条件下的基因表达数据，同时也提供了与病理数据相关的元数据。
2. GTEx（Genotype-Tissue Expression）：GTEx是一个基因表达数据库，它包含了多种组织和器官中的基因表达数据。虽然GTEx的主要关注点是正常组织，但它也提供了一些与病理相关的信息。
3. ICGC（International Cancer Genome Consortium）：ICGC是一个国际性的癌症基因组计划，它收集了全球各地不同类型癌症患者的基因组数据，并提供了与病理学和临床数据相关的信息。
4. TCGA的衍生数据库：除了TCGA本身，还有一些基于TCGA数据进行进一步分析和整理的衍生数据库，如Firehose、cBioPortal等。这些数据库提供了更多的病理和基因数据的整合和分析工具。
需要注意的是，不同数据库的数据来源和内容可能有所不同，因此在使用时需要根据具体需求选择合适的数据库。
更新于 2023年11月07日
