什么是「ATAC-seq 技术」?现在用于哪些生物学研究?
2023-10-30 阅读 32
ATAC-seq(Assay for Transposase-Accessible Chromatin using sequencing)技术是一种用于研究基因组中可访问性的高通量测序方法。它可以用来鉴定和分析细胞中的开放染色质区域,这些区域通常与基因的调控和表达有关。
ATAC-seq技术基于转座酶的作用原理。通过将转座酶引入到细胞中,它可以选择性地结合并切割开放的染色质区域,然后使用测序方法来鉴定和定量这些区域。这种方法不需要对DNA进行预处理或使用特定的抗体,因此具有较低的技术复杂性和成本。
ATAC-seq技术在生物学研究中具有广泛的应用。它可以用于研究基因组的调控机制、细胞分化和发育过程、疾病发生和进展等方面。例如,研究人类和其他生物的细胞类型和组织中的开放染色质区域,可以帮助我们理解基因表达调控的机制和细胞特异性。此外,ATAC-seq技术还可以用于研究疾病中的基因组变化,如肿瘤的发生和进展过程中的染色质重塑。总而言之,ATAC-seq技术为我们提供了一种全面了解基因组可访问性和调控机制的方法。
更新于 2023年10月30日