生信小白求大佬指点，在phytozome中有的基因在NCBI上搜不到？
2023-08-30 阅读 46
在生物信息学中，不同的数据库可能会包含不同的基因序列和注释信息。Phytozome和NCBI是两个常用的生物信息学数据库，它们可能会有一些差异。如果你在Phytozome中找到了一个基因，但在NCBI上找不到，有几种可能的原因：
1. 基因命名不同：不同数据库可能使用不同的命名规则和标准。尝试使用该基因的别名或同源序列来搜索。
2. 数据库更新不同步：数据库更新的速度和频率可能不同，导致某些基因在一个数据库中有，而在另一个数据库中还没有更新。
3. 数据库覆盖范围不同：不同数据库可能专注于不同的物种或基因组。如果你在Phytozome中找到的基因属于植物物种，而NCBI主要关注动物物种，那么在NCBI上可能找不到相应的注释信息。
如果你需要更多关于特定基因的信息，可以尝试使用其他数据库，如Ensembl、UniProt等。此外，还可以尝试使用基因序列或特定的功能特征进行BLAST搜索，以获取更多相关信息。
更新于 2023年08月30日
