哪些网站能批量预测基因是否为转录因子？
2023-08-07 阅读 38
有一些网站可以用来预测基因是否为转录因子。以下是一些常用的网站：
1. JASPAR：JASPAR数据库提供了大量的转录因子结合位点序列和相关信息，可以用于预测基因是否为转录因子。网址：http://jaspar.genereg.net/
2. TRANSFAC：TRANSFAC数据库是一个用于转录因子和转录调控元件的功能注释和预测的综合数据库。网址：http://www.gene-regulation.com/pub/databases.html#transfac
3. PROMO：PROMO是一个用于预测转录因子结合位点的在线工具，可以用于预测基因是否为转录因子。网址：http://alggen.lsi.upc.es/cgi-bin/promo_v3/promo/promoinit.cgi?dirDB=TF_8.3
4. MEME Suite：MEME Suite是一个用于分析DNA、RNA和蛋白质序列的在线工具集合，其中包括了一些用于预测转录因子结合位点的工具。网址：http://meme-suite.org/
这些网站提供了一系列的工具和数据库，可以帮助你预测基因是否为转录因子。请注意，预测结果可能需要进一步的验证和实验验证。
更新于 2023年08月07日
