导师给了转录组测序数据,让我帮他验证RNA表达水平,我应该怎么做?
2023-06-17 阅读 25
首先,您需要对转录组测序数据进行质量控制和预处理,例如去除低质量序列、去除接头序列、去除含有未知碱基的序列等。然后,您可以使用一些基因表达分析软件,例如DESeq2、edgeR、limma等,对预处理后的数据进行差异表达分析,以验证RNA表达水平。在进行差异表达分析之前,您需要对样本进行分组,例如将疾病组和对照组分开,然后比较两组之间的基因表达差异。最后,您可以对差异表达基因进行生物信息学分析,例如富集分析、通路分析等,以进一步了解这些基因的生物学功能。
更新于 2023年06月19日