在已有蛋白质PBD文件情况下,有什么软件或脚本能计算出其中的psi和phi角度吗?
2023-05-06 阅读 48
是的,有许多软件和脚本可以计算蛋白质PDB文件中的psi和phi角度。其中最常用的软件包括GROMACS、AMBER、CHARMM等分子动力学软件,以及MolProbity、Procheck等结构验证软件。此外,还有一些专门用于计算蛋白质结构参数的Python库,例如Biopython、MDAnalysis等。这些软件和脚本可以帮助用户快速、准确地计算出蛋白质结构中的psi和phi角度,并用于后续分析和研究。
更新于 2023年05月06日